Les rongeurs constituent l'ordre le plus important de la classe des mammifères, représentant presque la moitié de ceux-ci (2021 espèces de rongeurs sur 4629 de mammifères répertoriées). Ils constituent un ordre très diversifié, doté de grandes capacités d'adaptations écologiques qui les amènent à proliférer dans tous les milieux. Ce sont généralement des animaux terrestres de petite taille.

Dans le domaine de la santé, l'implication des rongeurs est fréquente. La richesse de leur parasitofaune fait qu'ils constituent, pour de nombreux parasites, des hôtes intermédiaires ou définitifs. Les maladies associées aux rongeurs peuvent être représentées en trois classes: celles qui sont directement ou indirectement transmises à l'homme, celles qui sont transmises aux animaux domestiques et enfin celles qui n'affectent que les rongeurs eux-mêmes.

Ces maladies peuvent être causées par des rickettsies, des bactéries, des protozoaires, des vers parasites ou des virus. Elles peuvent être transmises directement par morsure, plus souvent indirectement par les urines et les fèces et enfin surtout par l'intermédiaire d'arthropodes.

De plus, les techniques modernes de la systématique ont montré qu'il existe des ressemblances morphologiques entre espèces parfois phylogénétiquement assez éloignées, des divergences entre espèces relativement proches ou au contraire absence de critères externes d'identification entre espèces jumelles. Actuellement il devient donc  indispensable de faire appel à la cytogénétique et/ou à la biologie moléculaire pour une identification et une classification précise des rongeurs.

Dans ce cadre, l'objectif de cet atelier est de présenter un panorama complet des méthodes modernes de la systématique. Après cette première formation, le stagiaire devra être conscient de l'importance d'une identification précise d'un hôte que ce soit pour la lutte contre les maladies, l'agriculture ou la conservation. Il sera capable d'appréhender les techniques de capture et de prélèvements nécessaire aux analyses génétiques. Une initiation aux techniques de séquençage de l'ADN et à l'analyse des séquences sera proposée.

Après cette première formation de base l'identification spécifique exacte des rongeurs et de leur implication dans la circulation et le maintien des agents pathogènes qui est nécessaire quand on sait que des espèces du même genre peuvent avoir des sensibilités ou susceptibilités totalement différentes pour un même agent pathogène. Ainsi que des vulnérabilités différentielles à un quelconque agent de lutte, dans l'hypothèse d'une action entreprise contre l'espèce en question